柳州市妇幼保健院小儿外科建立于1997年， 2004年正式成为医院一级科室。现有病床60张，其中普通病床45张，新生儿病床15张。2006年3月，医院在上海儿童医学中心专家指导下，共同开展小儿心脏手术，正式启动“儿童心脏健康工程”。开展先天性心脏病矫治术十余年，完成各种先天性心脏病手术近千例。2015年成为柳州市临床重点专科，将科室打造成为结构合理、分工明确、专病专治的特色临床小儿外科。2018年再次评选成为柳州市临床重点专科，进行第二周期重点专科建设。2019年 福棠儿童医学发展研究中心儿童肿瘤专业委员会成员。2019年12月聘请北京儿童医院黄金狮教授成为科室学科顾问，学习北京儿童医院先进理念，追赶国内先进小儿外科的步伐。
现有医护人员42名，其中主任医师1名、副主任医师4名、主治医师4名、住院医师5名、研究生6名。副主任护师3名、主管护师5名、护师11名、护士9名。
小儿外科医、护团队业务骨干均派往国内知名专科医院进修学习，小儿外科得以在高起点上长足发展，专业技术水平不断提高，综合实力突飞猛进，学习国内外先进技术治疗理念及技术，为桂中地区儿童提供了具有专科特色的优质服务。按照全生命周期和三级预防的理念，让孕育腹中的胎儿到呱呱坠地的婴儿，从呀呀学语的儿童到朝气蓬勃的少年，都能得到小儿外科专科优质的医疗保健服务。
新生儿外科
诊治各类新生儿先天性结构畸形疾病，包括先天性肠闭锁、肛门闭锁、脐膨出、脊膜膨出、新生儿急性化脓性腹膜炎、幽门肥厚性狭窄、环状胰腺、先天性膈疝、食道闭锁、新生儿坏死性小肠结肠炎等新生儿外科疾病。近年来稳步开展新生儿腔镜手术及各种高难度的微创手术，争取在解决危重、疑难病例的同时，满足小创伤、恢复快等效果。其中开展的胸腔镜下膈疝修补术、腹腔镜下肠闭锁矫治手术、腹腔镜下肠旋转不良矫治术，在柳州及周边地区处于领先水平。科室每年手术治疗新生儿各种危重症病例数百例，体重最小仅为800g，成活率99%以上。
小儿胸心外科
诊治包扩先天性心脏病、先天性肺囊性腺瘤、隔离肺、先天性横膈疾病、胸壁畸形等胸科疾病。自2006年起开展小儿心脏病外科手术，经不断努力，已成功完成了1000多台各类心脏病手术，具备独立完成室间隔缺损、房间隔缺损、肺动脉狭窄、动脉导管未闭及法洛四联症、肺静脉异位引流等先天性心脏病矫治手术的能力。目前，心脏手术中婴幼儿占75%以上，最小年龄1个.月，最低体重2.75公斤，手术总成功率在98%以上。近两年，成功在胸腔镜辅助下手术治疗多例小婴儿肺囊性腺瘤样畸形、隔离肺。漏斗胸的治疗也在稳步开展中。
小儿普通外科
诊治包括腹股沟斜疝、、甲状舌骨囊肿、先天性淋巴管瘤、先天性胆总管囊肿、先天性巨结肠、肠扭转、肠套叠、脐茸、脐疝、脐膨出、急性阑尾炎、小肠重复畸形、肠穿孔、胃穿孔等小儿常见普通外科疾病。近年来成功开展了小婴儿3、4级复杂腔镜微创手术，成功通过微创手术治疗小儿先天性胆总管囊肿、先天性十二指肠梗阻、先天性肛门直肠畸形、先天性巨结肠、食管裂孔疝等危重疾病，常规开展阑尾炎、腹股沟斜疝微创手术，微创手术率、重大手术占比位于区内前列，推动该院小儿外科腔镜微创技术不断迈上新台阶，在为龙城患儿提供治疗的同时，影响力已扩大至桂中南地区，许多贵州、云南患儿均慕名前来就医。
小儿泌尿外科
诊治包括肾盂输尿管连接部梗阻、重复肾、肾和肾上腺肿瘤、膀胱输尿管梗阻返流、尿道下裂、先天性肾积水、隐匿性阴茎、鞘膜积液、隐睾、包茎等疾病。除了常规开展鞘膜积液、隐睾微创手术外，婴幼儿腹腔镜离断性肾盂成形术技术成熟，成功完成多例手术，在柳州市及周围地区处于领先水平。为解决每年暑假割包皮“一床难求”的情况，在区内率先开展包茎日间手术，当天入院当天出院，安全舒适地进行手术。
小儿肿瘤外科
收治包括血管瘤、淋巴管瘤、脂肪瘤、畸胎瘤（骶尾部畸胎瘤、睾丸畸胎瘤、卵巢肿瘤等）、肾母细胞瘤、肝母细胞瘤、神经母细胞瘤等小儿常见肿瘤疾病。其中通过平阳霉素、博来霉素腔内药物灌注技术治疗血管瘤、淋巴管瘤，效果良好，有效避免了患儿开刀手术的痛苦。2019年与医院多个科室一同组成小儿实体瘤诊治团队，全面开展小儿实体肿瘤的手术治疗业务，完成多例骶尾部畸胎瘤、睾丸畸胎瘤、卵巢肿瘤的手术治疗，同时也开展肾母细胞瘤的手术、化疗治疗。
柳州市妇幼保健院小儿外科还是广西先天性结构畸形定点医疗救治机构。小儿外科承接神经系统先天性畸形、消化系统先天性畸形、泌尿系统及生殖器官先天性畸形、肌肉骨骼系统先天性畸形、呼吸系统先天性畸形等疾病的手术救治，治疗效果满意。与妇产科、新生儿内科配合开展先天性畸形产前诊断、产前咨询及产后治疗等一条龙服务。构建的转运、急救、诊断、监护、麻醉、手术、护理、康复等完整成熟的新生儿危重症、疑难重症救治体系。成为柳州地市乃至桂中地区小儿外科疑难危重疾病治疗及转运目的医疗单位。
柳州市妇幼保健院小儿外科与北京儿童医院、上海儿童医学中心长期保有学术往来和合作交流，力求与国内领先技术接轨，促进临床工作水平进一步提升，造福柳州乃至全区的儿童患者。